Начал заниматься футболом в возрасте 5 лет в футбольной секции Василия Ивановича Бутакова. Воспитанник СДЮШОР «Зенит» (тренер — Владимир Молчанов). С 2007 года — футболист дублирующего состава «Зенита», с 2008 года — основного состава. В Кубке УЕФА сезона 2007/08 забил два гола. Первый мяч — во втором отборочном раунде словацкому «ВиОну» на 93-й минуте (2:0). Второй гол был забит немецкому «Нюрнбергу» на 79-й минуте, в 5-м туре группового раунда (2:2). За дублирующий/молодёжный состав в 2007—2009 годах провёл 47 игр, забил 12 голов. На тренировочных сборах, проводимых летом 2010 года, наигрывался на позицию левого защитника, хотя начинал карьеру в основном составе на позиции правого флангового нападающего. В рамках группового этапа Лиги Европы сезона 2010/11 Ионов забил два гола — хорватскому «Хайдуку» (3:2) и бельгийскому «Андерлехту» (3:1). В Суперкубке России 2011 против ЦСКА (1:0) забил победный гол на 73-й минуте матча. Первый гол за «Зенит» в чемпионате России забил 17 апреля 2011 года на 20 минуте матча в ворота «Амкара». 14 июня в матче против «Ростова» забил на 12-й секунде матча самый быстрый гол в истории «Зенита».