Свою футбольную карьеру Эмболо начал в юношеской школе базельского клуба «Нордштерн». В 2008 году он перешёл в молодёжную академию «Олд Бойз», а после 2010 года оказался в «Базеле». 13 марта 2014 года Эмболо дебютировал на профессиональном уровне, заменив на 90-й минуте в матче Лиги Европы против зальцбургского «Ред Булла» Серея Ди. Три дня спустя, 16 марта, состоялся первый матч Бреля в чемпионате Швейцарии против «Арау», завершившийся со счётом 5:0 в пользу красно-синих (сам Эмболо забил последний мяч). По достижении восемнадцати лет Брель заключил профессиональный контракт с «Базелем», рассчитанный до лета 2019 года. По итогам сезона 2014/15 вместе с командой выиграл чемпионат Швейцарии. 26 июня 2016 года перешёл в «Шальке 04» за 27 миллионов евро. Контракт подписан сроком на 5 лет. В 2019 году перешёл из «Шальке 04» в «Боруссию» (Мёнхенгладбах), с 22-летним швейцарцем подписан контракт до лета 2023 года. 15 июля 2022 года перешёл из «Боруссии» в «Монако» за 12,5 миллионов евро. Контракт рассчитан до лета 2026 года.