Эльяким Мангаля родился в небольшом французском городке Коломб, расположенном в 10 км от Парижа. Родители Эльякима — эмигранты из ДР Конго. В 1996 году семья переехала во франкоязычный валлонский Намюр в южной части Бельгии, где мальчик в возрасте пяти лет начал заниматься футболом — сначала в детской академии «Люстена», затем в «Вепьоне» и «Намюре», выступавшем в третьем дивизионе. В 2006 году Эльяким переехал в Льеж для обучения во франкоязычной школе «Варем», где познакомился с техническим директором детской академии «Стандарда». Тот порекомендовал футболиста к просмотру в юношеской команде, и в июне 2007 года Мангаля присоединился к игрокам «Стандарда» (до 17 лет), подписав полупрофессиональный контракт на три года. Через полгода футболист, наигрывающийся на позиции опорного полузащитника, пополнил ряды юношей до 19 лет.