В июле 2012 года перешёл в «Кубань», о чём было официально объявлено 19 июля. Переход нападающего «Осасуны» Ибраима Бальде обошелся «Кубани» в 3,5 миллиона евро. Треть этой суммы — 1,16 миллиона евро — получит мадридский «Атлетико», за который сенегальский форвард играл в период с 2008 по 2011 год. В своём дебютном матче за «Кубань», 27 августа 2012 года против «Волги», сделал «дубль». Всего в чемпионате России 2012/13 забил 8 голов в 23 матчах. 22 августа 2013 года в матче квалификационного раунда Лиги Европы против нидерландского «Фейеноорда» Бальде забил единственный гол и помог своей команде победить.