Педриньо перешёл в академию «Коринтианса» в 2013 году, до этого он играл в академии клуба «Витория». 19 марта 2017 года Педриньо дебютировал в основном составе «Коринтианс», выйдя на замену в матче Лиги Паулиста против клуба «Ферровиария». В марте 2020 года заключил пятилетний контракт с португальской «Бенфикой». Лиссабонский клуб заплатил за трансфер бразильца 20 миллионов евро. 9 июня 2021 года перешёл в донецкий «Шахтёр» за 18 миллионов евро. Для «горняков» данный трансфер стал вторым самым дорогим в истории, уступая только покупке Бернарда в 2013 году за 25 миллионов евро.