Штефан Белль — воспитанник футбольных клубов «Вер/Риден/Фолькесфельд» «Майен» и «Майнц 05». Сразу пробиться в основу «Майнца» защитнику не удалось и сезон 2010/11 он провёл, выступая на правах аренды за «Мюнхен 1860» во второй бундеслиге. Дебютировал за баварский клуб 29 августа 2010 года в матче чемпионата против «Оснабрюка». 26 сентября 2010 года, использовав подачу Беньямина Лаута со штрафного, Белль ударом головой забил свой первый гол за «Мюнхен» (в ворота Симона Йенцша из «Аугсбурга»). За сезон в составе «львов» Штефан Белль сыграл 24 матча, забил 2 гола и неоднократно ассистировал партнёрам по команде. Так, в матче с «Карлсруэ» 30 октября 2010 года 2 голевые передачи защитника (на Лаута и Бюлова) помогли баварскому клубу одержать выездную победу со счётом 4:2. В июле 2011 года защитник был отдан в аренду сроком на полгода франкфуртскому «Айнтрахту» и таким образом продолжил выступать во второй бундеслиге.