Уолкотт пришёл в стан «святых» в сезоне 2004/05 в возрасте 15 лет и достиг со своим клубом финала Молодёжного Кубка Англии. Вдобавок он стал самым молодым игроком «Сотона» в резервной команде, в которой он дебютировал в 15 лет и 175 дней. Перед стартом сезона 2005/06 Уолкотт был взят в предсезонное турне в Шотландию вместе с первой командой. В возрасте 16 лет и 143 дней он дебютировал в главной команде «Саутгемптона», став самым молодым игроком «святых», когда-либо выходившим в первой команде. Полноценный дебют Тео провёл 18 октября 2005 года в матче против «Лидс Юнайтед», забив в этой же игре гол. 4 дня спустя он также забил гол уже в ворота «Миллуолла». Яркий старт в футбольной карьере позволил Уолкотту получить награду «Самая молодая спортивная персона года по версии BBC». Его яркие выступления за «святых» не могли не обратить внимания топ-клубов Англии, и 20 января 2006 года он был продан в лондонский «Арсенал» за 5 млн фунтов стерлингов, но она могла возрасти до 12 млн, в зависимости от успешности выступления в составе «канониров».