Сезон 2018/19 «Шальке» начал плохо. После 9 туров у «кнаппен» всего 7 очков и всего 1 очко отрыва от зоны вылета. Коноплянка пропустил несколько матчей старта сезона из-за травмы. В матче против «Герты» получил красную карточку на последних минутах за срыв атаки. Вышел в стартовом составе и отдал голевую передачу в матче 6 тура против «Майнца» — в результате «Шальке» победил 1:0 и получил первые 3 очка в новом сезоне Бундеслиги. Несмотря на хорошие отзывы прессы (kicker долгое время называл Евгения лучшим полевым игроком «Шальке») и данные статистических порталов (лучший игрок команды по продвижению мяча вперёд, по ключевым передачам и многим другим характеристикам), Коноплянка всё чаще оказывался на скамейке запасных в Чемпионате Германии, тогда как в Лиге Чемпионов преимущественно выходил со стартового состава. В Лиге чемпионов «Шальке» попал в группу с «Порту», «Галатасараем» и московским «Локомотивом». В домашнем матче с «Порту» вышел на замену. Встречу с «Локомотивом» начал с первых минут и отдал голевую передачу на 88-ой минуте. Выездные матчи с «Галатасараем» и «Порту», а также домашний поединок 6-го тура с «Локомотивом» провел на хорошем уровне, заслужив положительные оценки СМИ и статистических сайтов. 2 сентября 2019 года Коноплянка вернулся в украинский чемпионат, подписав контракт с донецким «Шахтёром».