Трауко начал карьеру в клубе «Унион Комерсио». 13 февраля 2011 года в матче против «Альянса Лима» он дебютировал в чемпионате Перу. 20 февраля в поединке против «Хуан Аурич» Мигель забил свой первый гол за «Унион Комерсио». За пять сезонов Трауко сыграл за клуб более 150 матчей. В начале 2016 года Мигель перешёл в «Университарио». 7 февраля в матче против «Аякучо» он дебютировал за новую команду. 19 октября в поединке против «Альянса Атлетико» Трауко забил свой первый гол за «Университарио». В начале 2017 года Мигель стал игроком бразильского «Фламенго». 29 января в матче Лиги Кариока против «Боависты» Трауко дебютировал за новую команду. В этом же поединке Мигель забил свой первый гол за «Фламенго». 13 мая в матче против «Атлетико Минейро» он дебютировал в бразильской Серии A. 23 ноября 2019 года «Фламенго» выиграл Кубка Либертадорес, в ходе турнира Трауко провёл два матча. Также помог своей команде выиграть чемпионат штата и чемпионат Бразилии. Однако в августе 2019 года Мигель перешёл во французский «Сент-Этьен» и победителем чемпионата Бразилии и Кубка Либертадорес он стал уже постфактум.