Гонсалу является воспитанником системы «Порту». За вторую команду он дебютировал в сезоне 2013/14. В сезоне 2014/15 Гонсалу был игроком ротации фарм-клуба, а также начал привлекаться к играм первой команды. Его дебют за «Порту» состоялся 25 января 2015 года в матче против «Маритиму». Это был его единственный матч за первую команду в дебютном сезоне. 12 июля 2018 года «Айнтрахт» выкупил игрока у «Порту». 2 марта 2019 года в матче против «Хоффенхайма» Пасиенсия забил первый гол за клуб.