Воспитанник клубов «Париж» и «Сошо». 10 января 2017 года в поединке Кубка лиги против «Монако» Ибраима дебютировал в составе последнего. 7 февраля в матче против «Осера» он дебютировал в Лиге 2. 7 апреля в поединке против «Ньора» Ибраима забил свой первый гол за «Сошо». Летом 2017 года Конате подписал пятилетний контракт с немецким «РБ Лейпциг». 1 октября в матче против «Кёльна» он дебютировал в Бундеслиге.