Кристофер Айер воспитанник футбольного клуба «Лиллестрём». В 2014 году начал профессиональную карьеру в клубе «Старт». 17 февраля 2016 года подписал четырёхлетний контракт с шотландским клубом «Селтик», за который начал выступать с сезона 2016/17. 21 июля 2021 года перешёл в английский клуб «Брентфорд», подписав пятилетний контракт.