Жуниор — воспитанник клуба «Деспортиво Бразил». Летом 2017 года он подписал пятилетний контракт с нидерландским ПСВ. Для получения игровой практики Мауро начал выступать за команду дублёров. 21 августа в матче против «Де Графсхап» он дебютировал в Эрстедивизи. 15 октября в матче против «ВВВ-Венло» он дебютировал Эредивизи за основной состав. В этом же поединке Мауро забил свой первый гол за ПСВ. В своём дебютном сезоне он стал чемпионом Нидерландов. Летом 2019 года перешёл на правах аренды в «Хераклес».