Воспитанник футбольной академии амстердамского «Аякса». 26 сентября 2018 года дебютировал в основном составе «Аякса» в матче Кубка Нидерландов против «Те Верве». 7 июля 2019 года перешёл во французский клуб «Пари Сен-Жермен» в качестве свободного агента, подписав четырёхлетний контракт. 29 января 2020 года дебютировал за ПСЖ в матче Кубка Франции против клуба «По». 15 февраля дебютировал во французской Лиге 1, выйдя в стартовом составе ПСЖ в матче против «Амьена». 24 июля 2020 года вышел в стартовом составе ПСЖ на финальный матч Кубка Франции, в котором парижане обыграли «Сент-Этьен». 31 июля 2020 года Баккер вновь вышел в стартовом составе ПСЖ на финал Кубка французской лиги против «Лиона», в котором парижане одержали победу в серии послематчевых пенальти.