Прёппер начал заниматься футболом в молодёжном составе клуба «Витесс». На молодёжном уровне также играл в клубе «Де Графсхап». В профессиональном футболе Прёппер дебютировал 17 августа 2012 года в матче против «Гоу Эхед Иглс», где вышел на замену на 88-й минуте матча . Свой первый гол за клуб Прёппер забил в следующем же матче против «Хелмонд Спорт» на 23-й минуте. В этом же матче Прёппер сделал результативную передачу на Тима Винккена. В апреле 2015 года Прёппер продлил свой контракт с «Де Графсхап» до конца сезона 2015/16. 26 мая 2016 года было объявлено о переходе Робина в «Хераклес». В июле 2021 года перешёл в «Твенте», подписав с клубом трёхлетний контракт.