Йенсен — воспитанник клубов «Видовре» и «Копенгаген». В 2017 году Виктор перешёл в амстердамский «Аякс». Сумма трансфера составила 3,5 млн. евро. 12 января 2018 года в матче против ситтардской «Фортуны» он дебютировал за команду дублёров в Эрстедивизи. В 2020 году Виктор был включён в заявку на сезон. 12 декабря 2020 года в матче против «Зволле» он дебютировал в Эредивизи за основной состав. В начале 2021 года для получения игровой практики Йенсен был арендован клубом «Норшелланн». 4 февраля в матче против «Брондбю» он дебютировал в датской Суперлиге. 14 февраля в поединке против «Вайле» Виктор забил свой первый гол за «Норшелланн». По окончании аренды Йенсе вернулся в «Аякс».