Профессиональную карьеру начал за фарм-клуб «Лилль». Дебют в Лиге 1 состоялся 2 марта 2014 года в матче против «Аяччо». Второе его появление за основную команду состоялось 12 апреля того же года в матче против «Валансьен». Сезон 2017/18 Коне провёл в аренде в клубе «Реймс». 3 июля 2019 году Коне перешёл в «Олимпик Лион» за 9 млн евро. В феврале 2021 года перешёл в турецкий «Хатайспор» на правах аренды. 21 февраля дебютировал в чемпионате Турции в матче против «Эрзурумспора», выйдя на замену на 71-й минуте вместо Александроса Катраниса.